Сиговые рыбы. Основным объектом селекции среди сиговых рыб является пелядь - озерный планктофаг, обладающий высоким темпом роста.
Селекционные работы с пелядью проводятся в СССР с 1972 г. Материалом для этих работ послужили производители, выращенные на ЦЭС ”Ропша” (Ленинградская область) из икры, собранной в 1970 г. и 1973 г. на оз. Ендырь (Западная Сибирь).
На начальном этапе проводили популяционно -генетические исследования (определение наследуемости селекционных признаков, анализ биохимического полиморфизма и др.). На основе этих данных были определены методы отбора и системы разведения пеляди в условиях искусственного воспроизводства.
Основным направлением селекции пеляди является более позднее (в нерестовом сезоне) созревание самок, которое позволяет приурочить срок получения молоди ко времени массового развития в прудах кормовых объектов. Учитывались и некоторые другие репродуктивные признаки (плодовитость, размер икры и др.), а также масса тела рыб.
Исходное стадо ендырской пеляди включает две группы, различающиеся по сроку созревания самок в нерестовом сезоне. Проведение однократного отбора позволило сдвинуть срок полового созревания производителей в нерестовом сезоне на 15-20 сут и сформировать группу "поздно созревающих" самок. Плодовитость рыб увеличилась на 30-45 % (по сравнению с исходным уровнем).
Селекционная программа работ с пелядью предусматривает многолинейную систему разведения. С этой целью от парного скрещивания производителей заложено несколько инбредных групп. Часть линий заложена с применением индуцированного гиногенеза. Дифференцировка селекционируемых групп по биохимическим маркерам позволяет рассчитывать на получение гетерозисного эффекта при скрещивании.
Осетровые. Работы по селекции осетровых проводятся только в СССР. Основным объектом селекции до последнего времени являлись гибрид белуга х стерлядь (бестер). Ведутся также работы с разными типами возвратных гибридов.
В последние годы большое внимание уделяется формированию маг точных стад "чистых" видов осетровых: стерляди, ленского осетра, шипа и др. Особенно интенсивные исследования проводятся с ленским осетром, маточные стада которого формируются в ряде рыбхозов Центральной зоны РСФСР, Молдавии и других районов страны. Весьма перспективным для рыбохозяйственного использования и селекции является веслонос - единственный представитель осетровообразных, питающийся зоопланктоном.