Применение индуцированного гиногенеза позволяет решать и ряд других важных задач. Выше была показана целесообразность использования этого метода совместно с индуцированным мутагенезом для ускоренного выявления рецессивных мутаций при мутагенной селекции. С помощью гиногенеза можно выявлять редкие рецессивные гены и при обычной селекции. Индуцированный гиногенез представляет интерес как способ получения однополо-женских потомств, выращивание которых во многих случаях более выгодно, чем обычных двуполых. Исследование гиногенетических потомств дает селекционеру важные сведения об особенностях проявления инбредной депрессии у разных видов рыб при разной степени инбридинга. Генетически однородные линии могут служить удобным материалом для изучения влияния модификационных факторов на изменчивость признака. В специальных генетических работах с помощью индуцированного гиногенеза можно определить локализацию генов на хромосоме относительно центромеры (картировать гены). Ниже будет показано использование гиногенеза в работах с отдаленными гибридами рыб.
В области практического использования данного метода наибольшие успехи достигнуты на карпе. Разработана технология получения гиногенетических потомств карпа в промышленных масштабах, с помощью которой получены десятки тысяч диплоидных гиногенетических карпов. Как упоминалось выше, данный метод применяется в селекции казахстанского карпа, его использование предусмотрено программой селекции среднерусского карпа. Наиболее продвинуто использование гиногенеза в селекции венгерского карпа; здесь от разных селекционных групп карпа получены гиногенетические линии (включая четвертое последовательное поколение индуцированного гиногенеза) и проведены промышленные скрещивания с их участием. Начато использование индуцированного гиногенеза в селекции пеляди. В работах с форелью и другими видами рыб индуцированный гиногенез успешно применяется для регуляции пола и получения однополо-женских потомств.